Predavanje dr. sc. Marine Rožman, University of Essex, pod naslovom Suvremene metode istraživanja enzimske reakcije korištenjem X-zračne kristalografije, održat će se u ponedjeljak 30. lipnja 2025. godine u 14.30h u predavaonici O-030.
Sažetak
X-zračna kristalografija postaje nužna metoda za istraživanje enzimskih reakcija jer doprinosi informacijama o strukturalnim karakteristikama prijelaznih stanja i time nadopunjuje klasične spektroskopske metode. Glavni cilj istraživanja enzimskih reakcija jest karakterizirati prijelazna stanja. Prijelazna stanja imaju kratko vrijeme poluraspada (sekunde, milisekunde i kraće) što otežava njihovo istraživanje klasičnom X-zračnom kristalografijom kod koje su često potrebne minute za pripremu uzorka. Stoga, veliki je fokus na razvijanju novih metoda pripreme uzorka i mjerenja. Zahvaljujući razvitku X-ray free electron lasera (XFEL), lasera koji proizvode vrlo intenzivnu i fokusiranu pulsirajuću X-zraku, moguće je pratiti enzimske reakcije na femtosekundarnoj razini. Jedna od glavnih poteškoća kod takvih istraživanja jest započinjanje reakcije in situ. U ovom seminaru, predstavit ću nekoliko metoda za inicijaciju reakcije, od kojih se jedna bazira na fotokavezima koji se raspadaju pri svjetlosti i time oslobađaju molekulu od interesa, npr. kisik, koja je bila zarobljena u fotokavezu. Nadalje, predstavit ću svoj rad na formilglicin-generirajućem enzimu (FGE), enzimu koji koristi kisik kako bi pretvorio cistein u formilglicin, nužnu kotranslacijsku modifikaciju kod sinteze sulfataza. FGE je jedna od meta za koju razvijamo O2- fotokavez.